Por opción predeterminada, Minitab Statistical Software produce resultados para el árbol más pequeño con un valor de criterio dentro de un error estándar del mejor valor. El criterio es el mínimo cuadrado de error o la desviación absoluta mínima, dependiendo de su elección. Minitab le permite explorar otros árboles de la secuencia que condujo a la identificación del árbol óptimo. Normalmente, se selecciona un árbol alternativo por una de las dos razones siguientes:
- El árbol que Minitab selecciona es parte de un patrón donde el criterio mejora. Uno o más árboles que tienen algunos nodos más forman parte del mismo patrón. Normalmente, lo que se desea es realizar predicciones a partir de un árbol con la mayor exactitud de predicción posible.
- El árbol que Minitab selecciona es parte de un patrón donde el criterio es relativamente plano. Uno o más árboles con estadísticas de resumen del modelo similares tienen muchos menos nodos que el árbol óptimo. Normalmente, un árbol con menos nodos terminales proporciona una imagen más clara de cómo cada variable predictora afecta a los valores de respuesta. Un árbol más pequeño también facilita la identificación de algunos grupos objetivo para estudios posteriores. Si la diferencia en la exactitud de predicción para un árbol más pequeño es insignificante, también puede utilizar el árbol más pequeño para evaluar las relaciones entre la respuesta y las variables predictoras
Por ejemplo, la siguiente gráfica acompaña los resultados sobre el árbol con 21 nodos. Otros árboles de la secuencia tienen valores similares de R
2.

El árbol de 17 nodos tiene un valor de R
2 que es casi tan alto como el árbol de 21 nodos. Normalmente, un árbol con menos nodos terminales proporciona una imagen más clara de cómo cada variable predictora afecta a los valores de respuesta. Un árbol más pequeño también facilita la identificación de algunos grupos objetivo para estudios posteriores. Si la reducción de la exactitud de predicción de un árbol mucho más pequeño es insignificante, puede utilizar el árbol mucho más pequeño para evaluar las relaciones entre la respuesta y las variables predictoras.

Además de los valores de criterio para árboles alternativos, también puede comparar la complejidad de los árboles y la utilidad de diferentes nodos. Considere los siguientes ejemplos de razones por las que un analista elige un árbol determinado que no sacrifica el rendimiento en comparación con otros árboles:
- El analista elige un árbol más pequeño que proporciona una vista más clara de las variables más importantes.
- El análisis elige un árbol porque las divisiones están en variables que son más fáciles de medir que las variables de otro árbol.
- El analista elige un árbol porque un nodo terminal determinado es de interés.