Um modelo hierárquico é um modelo onde, para cada termo no modelo, todos os termos de ordem inferior contidos nele também estão no modelo. Por exemplo, suponha que existe um modelo com quatro fatores: A, B, C e D. Se o termo A * B * C estiver no modelo, os termos A, B, C, A*B, A*C e B*C também devem estar no modelo, embora termos com D não precisem estar no modelo. A estrutura hierárquica se aplica ao aninhamento também. Se B (A) estiver no modelo, A também deve estar.
Um modelo não é hierárquico quando não contém todos os termos de ordem inferior para cada termo no modelo.