A variância da resposta é apropriada para cálculos de potência e tamanho amostral em ANOVA?

A variância que é importante em uma ANOVA não é a variância da resposta. A variância importante é a variância do termo de erro.

Se existe um efeito significante do tratamento no modelo, a variação da resposta é muito maior do que a variância do termo de erro porque o tratamento explica parte da variação na resposta.

O erro médio quadrado é a melhor estimativa da variação do termo de erro. O erro médio quadrado a partir de um estudo piloto é tipicamente útil quando você deseja executar cálculos de poder e de tamanho amostral para uma ANOVA.