변량 요인이 포함되거나 변량 요인과 교차하는 항에는 비교를 사용할 수 없습니다. 내포는 교호작용의 한 형태입니다. 모형에 A B C A*B가 포함되어 있다고 가정합니다(여기서 A와 C는 변량, B는 고정 요인입니다). A*B 항이 모형에 포함되어 있으므로 B가 고정 요인인 경우에도 B에 대한 다중 비교 결과를 이용할 수 없습니다. 그러나 모형에 A*B가 포함되어 있지 않으면 B에 대한 다중 비교 결과를 이용할 수 있습니다.
요인이 두 개인 균형 설계의 경우 특별한 경우가 있습니다. 모형에 A B A*B가 포함되어 있다고 가정합니다(여기서 A는 변량, B는 고정 요인입니다). A*B가 모형에 있어도 B에 대해 다중 비교를 수행할 수 있습니다.