分散成分は、変量因子を原因とする応答の変動量を評価します。変量因子を持つモデルを分析するには、通常は混合効果モデルの当てはめを使用します。一般線形モデルの適合は変量因子の分散成分も推定しますが、設計がアンバランス型のときの[混合効果モデルを適合]の方が優れた推定を行います。一般線形モデルの適合と[混合効果モデルを適合]は、バランス型データでは、同じ分散成分を計算します。
変量因子の水準はランダムに選択されたもので、固定因子の場合は関係する水準のみです。たとえば、ランダムに選択された作業者によって測定された出力に関して、2つの圧力水準の効果を分析するとします。圧力は固定(2つの水準)されており、作業者はランダムに選択されています。分散成分出力には、作業者と誤差項の分散の推定値がリストされます。固定因子と変量因子に関する詳細は、固定因子と変量因子の違いを参照してください。