混合効果モデルには、固定効果とランダム効果の両方が含まれます。混合効果モデルの一般形は以下になります。
y = Xβ + Z1μ1+ Z2μ2 + ... + Zcμc + ε
| 用語 | 説明 |
|---|---|
| y | 応答値のn x 1ベクトル |
| X | 固定効果項がp ≤ nの場合のn x p計画行列 |
| β | 未知のパラメータのp x 1ベクトル |
![]() | n x mi計画行列はモデル内の ランダム項に対応 |
| μi | 次から得られる独立変数のmi x 1ベクトル:N(0, ) |
| ε | 次から得られる独立変数のn x 1ベクトル:N(0, ) |
| n | 観測値数 |
| p | パラメータ数![]() |
| c | モデル内のランダム項の数 |
混合効果モデルの一般形のモデルの仮定に基づき、応答ベクトルyは、平均ベクトルXβの多変量正規分布となり、次の分散共分散行列を持ちます。
V(σ2) = V(σ2, σ21, ... , σ2c) = σ2In + σ21Z1Z'1 + ... + σ2cZcZ'c
ここで
σ2 = (σ2, σ21, ... , σ2c)'
σ2, σ21, ... , σ2cは分散成分と呼ばれます。
分散から因数分解することで、混合効果モデルの対数尤度の計算部分にあるH(θ)の表現を見つけることができます。
V(σ2) = σ2H(θ) = σ2[In + θ1Z1Z'1 + ... + θcZcZ'c]
| 用語 | 説明 |
|---|---|
![]() | ![]() |
| θi | 誤差分散内の ランダム項の分散の比率 |


| 用語 | 説明 |
|---|---|
| H | In + θ1Z1Z'1 + ... + θcZcZ'c |
| |H| | Hの行列式 |
| H-1 | Hの逆行列 |
| mi | ランダム項の水準数 |
![]() | 誤差の分散成分 |
| In | nの行と列を持つ恒等行列 |




ここで、


に関しては
。Minitabではニュートン法により
の推定が以下の手順で行なわれます。
の解は分散比の推定値です。このとき
ランダム項の分散成分は以下になります。

| 用語 | 説明 |
|---|---|
| tr(·) | 行列の跡 |
| X' | Xの転置 |