La variance de la réponse est-elle adéquate pour des calculs de puissance et d'effectif d'échantillon dans une analyse ANOVA ?

La variance de la réponse n'est pas celle qui importe dans une ANOVA. C'est la variance du terme d'erreur qui a le plus d'importance.

Si l'effet d'un traitement du modèle est significatif, la variation de la réponse sera beaucoup plus élevée que celle du terme d'erreur car le traitement explique une partie de la variation de la réponse.

L'erreur quadratique moyenne constitue la meilleure estimation de la variance du terme d'erreur. L'erreur quadratique moyenne issue d'une étude pilote est généralement utile lorsque vous souhaitez réaliser des calculs de puissance et d'effectif d'un échantillon pour une analyse ANOVA.